基于高通量测序技术分析患病与健康虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)闭壳肌菌群多样性

生态学杂志

基于高通量测序技术分析患病与健康虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)闭壳肌菌群多样性

窦妍¹,赵晓伟¹,丁君^1*,刘圣聪²,张涛²

(¹大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室，辽宁大连 116023； ²大连天正实业有限公司，辽宁大连 116023)

出版日期:2016-04-10 发布日期:2016-04-10

Application of high-throughput sequencing for analyzing bacterial diversity in the adductor muscle of sick and healthy Patinopecten yessoensis.

DOU Yan¹, ZHAO Xiao-wei¹, DING Jun^1*, LIU Sheng-cong², ZHANG Tao²

(Key Laboratory of Mariculture & Stock Enhancement in North China’s Sea, Ministry of Agriculture, Dalian Ocean University, Dalian 116023, Liaoning, China; Dalian Tianzheng Industry Co., Ltd., Dalian 116023, Liaoning, China).

Online:2016-04-10 Published:2016-04-10

摘要/Abstract

摘要： 本研究取自同一养殖海域不同浮筏养殖笼中健康和患脓包病虾夷扇贝（Patinopecten yessoensis）样品，健康虾夷扇贝样品标记为CK，患病样品分别标记为S1、S2和S3，使用MiSeq高通量测序技术比较不同生存状态的虾夷扇贝的微生物组成与差异。结果表明：4个样品中菌群多样性表现为S3>CK>S1>S2；4个样品中的细菌可归为24个门，主要门类有变形菌门、拟杆菌门、浮霉菌门、梭杆菌门、厚壁菌门、酸杆菌门、放线菌门、硝化螺旋菌门、绿菌门和绿弯菌门；在健康虾夷扇贝样品中，变形菌门占绝对优势，占整个菌群的95.9%，患病虾夷扇贝样品中，S1和S3中优势类群均为变形菌门，分别占整个菌群的80.4%和86.8%，S2中优势菌群为拟杆菌门，占56.9%。

关键词: 节能减碳效率, 非期望产出DEA模型, CO₂, 辽宁省

Abstract: Healthy and sick samples of Patinopecten yessoensis were taken from different culturing cages. The healthy samples were tagged as CK and the sickness samples were tagged as S1, S2 and S3 respectively. Using MiSeq sequencing method, we compared the microbial structure and variation of P. yessoensis in different healthy status. The results showed that the bacterial diversity was highest in the S3, followed by the CK, S1 and S2. In total, 24 phyla were identified in this study. Among these phyla, Proteobacteria, Bacteroidetes, Planctomycetes, Chloroflexi, Firmicutes, Acidobacteria, Actinobacteria, Nitrospirae, Chlorobi and Fusobacteria took up a large proportion. Proteobacteria were absolutely dominant in the adductor muscle of healthy P. yessoensis, accounting for 95.9% in the entire bacterial community. In the adductor muscle of the sick P. yessoensis, the dominant groups of S1 and S3 were Proteobacteria, accounting for 80.4% and 86.8% respectively, while Bacteroidetes (56.9%) were the dominant phyla in S2.

Key words: Liaoning Province, CO₂, energy saving and carbon emission reduction efficiency, undesirable output DEA model

窦妍1,赵晓伟1,丁君1*,刘圣聪2,张涛2. 基于高通量测序技术分析患病与健康虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)闭壳肌菌群多样性[J]. 生态学杂志.

DOU Yan1, ZHAO Xiao-wei1, DING Jun1*, LIU Sheng-cong2, ZHANG Tao2. Application of high-throughput sequencing for analyzing bacterial diversity in the adductor muscle of sick and healthy Patinopecten yessoensis.[J]. cje.

[1]	曾思洁, 朱俊杰. 植物非叶组织器官光合作用研究进展 [J]. 生态学杂志, 2023, 42(9): 2241-2249.
[2]	马方园, 张莉, 翁子珊, 赖金美, 刘桂珍, 郭豪, 易志刚. 大气CO₂和O₃浓度增加对闽楠异戊二烯和单萜烯释放的影响 [J]. 生态学杂志, 2023, 42(8): 1802-1810.
[3]	张志斌, 于晓曼, 刘鸣达, 李金妮. 基于能值分析的重工业区域绿色生态一体化发展研究 [J]. 生态学杂志, 2023, 42(8): 1963-1972.
[4]	崔景会, 王怡丹, 齐秀芬, 王旭昊, 田露, 王兰兰. 水分胁迫和高浓度CO₂处理下水稻幼苗光合生理响应特征 [J]. 生态学杂志, 2023, 42(6): 1381-1388.
[5]	李敏, 贾羽旋, 孙娟, 王斌, 武雨欣, 王顺利, 石生伟. 大气CO₂浓度上升与增温对双季稻田溶解性有机碳变化特征的影响 [J]. 生态学杂志, 2023, 42(3): 653-661.
[6]	韩诗慧, 刘蕾, 周国逸, 李琳, 方雪纯. 森林土壤甲烷吸收对全球变化的响应 [J]. 生态学杂志, 2023, 42(12): 3030-3037.
[7]	潘鸿, 曹吉鑫, 陈展, 尚鹤. CO₂浓度升高对木荷幼苗光合特征的影响 [J]. 生态学杂志, 2022, 41(5): 865-872.
[8]	王继龙, 王晓锋, 袁兴中, 吴胜男, 李航. 源头溪流CO₂排放特征及其影响因素研究进展 [J]. 生态学杂志, 2022, 41(5): 1001-1014.
[9]	王子威, 贾夏, 闫占宽, 曹柯萌, 张春燕, 王璐, 张宁静, 高云峰. 大气CO₂浓度升高和Cd污染耦合对刺槐幼苗根微域土壤酚酸积累的影响 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(7): 2067-2075.
[10]	李梦娇, 陈甜, 洪小敏, 余坦蔚, 胡亚林. 不同化学结构外源碳添加对红壤和沙土有机碳矿化动态的影响 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(6): 1609-1617.
[11]	罗光宇, 陈超, 李月灵, 金则新. 光照强度对濒危植物长序榆光合特性的影响 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(4): 980-988.
[12]	杨靖睿, 曹培培, 杨凯, 吕春华, 王艺杰, 孙文娟, 于凌飞. CO₂浓度升高和不同氮肥水平下源库处理对粳稻茎鞘非结构性碳水化合物积累和转运的影响 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(3): 615-626.
[13]	孔璐, 徐柱, 王玉刚, 刘冉. 白杨（Populus tomentosa）与小叶锦鸡儿（Caragana microphylla）枝干光合作用比较 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(10): 3060-3069.
[14]	何方杰, 韩辉邦, 马学谦, 张劲松, 孙守家. 隆宝滩保护区不同生态系统CH₄和CO₂通量差异及其影响因素 [J]. 生态学杂志, 2020, 39(9): 2821-2831.
[15]	马铭婧,郗凤明,王娇月,尹岩,常莎莎. 高炉渣CO₂矿化利用技术的生命周期碳排放与成本评价 [J]. 生态学杂志, 2020, 39(6): 2097-2105.