链状亚历山大藻共附生细菌多样性

生态学杂志

链状亚历山大藻共附生细菌多样性

刘兵¹;李宇²; 叶倩²;李太武¹;苏秀榕¹;李登峰¹;陈燕¹;史西志¹

¹宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室，浙江宁波 315211;²宁波海事局，浙江宁波 315020

收稿日期:2008-09-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2009-05-10 发布日期:2009-05-10

Phylogenetic diversity of bacteria associated with dinoflagellate Alexandrium catenella.

LIU Bing¹;LI Yu²;YE Qian²;LI Tai-wu¹;SU Xiu-rong¹;LI Deng-feng¹;CHEN Yan¹;SHI Xi-zhi¹

¹Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology of Ministry of Education, Ningbo University, Ningbo 315211, Zhejiang, China;²Ningbo Maritime Safety Administration, Ningbo 315020, Zhejiang, China

Received:2008-09-01 Revised:1900-01-01 Online:2009-05-10 Published:2009-05-10

摘要/Abstract

摘要： 采用非分离培养分析方法，直接提取链状亚历山大藻（Alexandrium catenella）共附生细菌总DNA，以之为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA基因片段，并构建16S rDNA克隆文库。通过16S rDNA限制性酶切片段长度多态性（restriction fragment length polymorphism，RFLP）和测序方法对链状亚历山大藻共附生细菌的多样性进行了研究。84个16S rDNA克隆片段经限制性内切酶HaeⅢ酶切分析，得到30种不同的酶切指纹类型。挑选50个克隆子进行测序获得其16S rDNA部分序列，并对16S rDNA序列进行聚类分析构建了系统进化树。结果表明，链状亚历山大藻共附生的细菌多样性较强，优势细菌类群为变形菌α亚群（α-Proteobacteria）和拟杆菌（Bacteroidetes），其中玫瑰杆菌（Roseobacter sp.）在α-Proteobacteria中占绝对优势。

关键词: 生态系统, 服务, 价值, 遥感, 测量

Abstract: The phylogenetic diversity of bacteria associated with Alexandrium catenella was studied by 16S rDNA gene sequences. With culture-independent approach, the total bacterial DNA was extracted from A. catenella. 16S rDNA genes were amplified by PCR, and a 16S rDNA clone library was constructed. The phylogenetic diversity of the bacteria was determined by RFLP-16S rDNA sequencing of cloned DNA fragments. A total of 84 cloned 16S rDNA fragments were digested with restriction endonucleases HaeⅢ, and 30 different PFLP types were obtained. Fifty cloned partial sequences were acquired, most of which were related to Proteobacter, and mainly attributed to α-Proteobacteria and Bacteroidetes in the phylogenetic tree. In α-Proteobacteria, Roseobacter sp. was the dominant clade. This study demonstrated the prolific bacterial diversity of A. catenella.

Key words: Ecosystem, Service, Value, Remote sensing, Measurement

刘兵;李宇; 叶倩;李太武;苏秀榕;李登峰;陈燕;史西志. 链状亚历山大藻共附生细菌多样性[J]. 生态学杂志.

LIU Bing¹;LI Yu²;YE Qian²;LI Tai-wu¹;SU Xiu-rong¹;LI Deng-feng¹;CHEN Yan¹;SHI Xi-zhi¹. Phylogenetic diversity of bacteria associated with dinoflagellate Alexandrium catenella.[J]. cje.

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