链状亚历山大藻共附生细菌多样性

生态学杂志

链状亚历山大藻共附生细菌多样性

刘兵¹;李宇²; 叶倩²;李太武¹;苏秀榕¹;李登峰¹;陈燕¹;史西志¹

¹宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室，浙江宁波 315211;²宁波海事局，浙江宁波 315020

收稿日期:2008-09-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2009-05-10 发布日期:2009-05-10

Phylogenetic diversity of bacteria associated with dinoflagellate Alexandrium catenella.

LIU Bing¹;LI Yu²;YE Qian²;LI Tai-wu¹;SU Xiu-rong¹;LI Deng-feng¹;CHEN Yan¹;SHI Xi-zhi¹

¹Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology of Ministry of Education, Ningbo University, Ningbo 315211, Zhejiang, China;²Ningbo Maritime Safety Administration, Ningbo 315020, Zhejiang, China

Received:2008-09-01 Revised:1900-01-01 Online:2009-05-10 Published:2009-05-10

摘要/Abstract

摘要： 采用非分离培养分析方法，直接提取链状亚历山大藻（Alexandrium catenella）共附生细菌总DNA，以之为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA基因片段，并构建16S rDNA克隆文库。通过16S rDNA限制性酶切片段长度多态性（restriction fragment length polymorphism，RFLP）和测序方法对链状亚历山大藻共附生细菌的多样性进行了研究。84个16S rDNA克隆片段经限制性内切酶HaeⅢ酶切分析，得到30种不同的酶切指纹类型。挑选50个克隆子进行测序获得其16S rDNA部分序列，并对16S rDNA序列进行聚类分析构建了系统进化树。结果表明，链状亚历山大藻共附生的细菌多样性较强，优势细菌类群为变形菌α亚群（α-Proteobacteria）和拟杆菌（Bacteroidetes），其中玫瑰杆菌（Roseobacter sp.）在α-Proteobacteria中占绝对优势。

关键词: 生态系统, 服务, 价值, 遥感, 测量

Abstract: The phylogenetic diversity of bacteria associated with Alexandrium catenella was studied by 16S rDNA gene sequences. With culture-independent approach, the total bacterial DNA was extracted from A. catenella. 16S rDNA genes were amplified by PCR, and a 16S rDNA clone library was constructed. The phylogenetic diversity of the bacteria was determined by RFLP-16S rDNA sequencing of cloned DNA fragments. A total of 84 cloned 16S rDNA fragments were digested with restriction endonucleases HaeⅢ, and 30 different PFLP types were obtained. Fifty cloned partial sequences were acquired, most of which were related to Proteobacter, and mainly attributed to α-Proteobacteria and Bacteroidetes in the phylogenetic tree. In α-Proteobacteria, Roseobacter sp. was the dominant clade. This study demonstrated the prolific bacterial diversity of A. catenella.

Key words: Ecosystem, Service, Value, Remote sensing, Measurement

刘兵;李宇; 叶倩;李太武;苏秀榕;李登峰;陈燕;史西志. 链状亚历山大藻共附生细菌多样性[J]. 生态学杂志.

LIU Bing¹;LI Yu²;YE Qian²;LI Tai-wu¹;SU Xiu-rong¹;LI Deng-feng¹;CHEN Yan¹;SHI Xi-zhi¹. Phylogenetic diversity of bacteria associated with dinoflagellate Alexandrium catenella.[J]. cje.

[1]	徐彩仙, 巩杰, 燕玲玲, 高秉丽, 李焱. 甘肃白龙江流域土壤保持服务供需风险时空变化 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(5): 1397-1408.
[2]	陈思明. 三沙湾海水养殖区时空动态变化及其影响因素 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(4): 1137-1145.
[3]	李婷婷, 马超, 郭增长. 基于RSEI模型的贺兰山长时序生态质量评价及影响因素分析 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(4): 1154-1165.
[4]	程琳琳, 王振威, 田素锋, 柳亚彤, 孙梦尧, 杨玉曼. 基于改进的遥感生态指数的北京市门头沟区生态环境质量评价 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(4): 1177-1185.
[5]	杨艳芬, 角媛梅, 刘澄静, 丁银平, 刘志林, 徐秋娥. 全球水稻梯田生态系统服务研究进展 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(3): 876-886.
[6]	张晓瑶, 陆林, 虞虎, 张潇, 李冬花. 青藏高原土地利用变化对生态系统服务价值影响的多情景模拟 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(3): 887-898.
[7]	王玉洁, 周炳江, 黄郑雯, 孙荣卿, 杨宽, 杨霖, 程希平. 元江干热河谷林地内外潜在蒸散发量的变化及其驱动因素 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(2): 501-511.
[8]	魏玉莲. 森林生态系统中木腐真菌群落形成机理及生态功能 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(2): 534-543.
[9]	于道德, 宋静静, 叶海斌, 王友红, 王晓璐, 刘洪军. 生态理念下对虾健康养殖发展建议 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(2): 568-576.
[10]	蔡德峰, 张扬建, 丛楠, 殷国栋, 王荔, 张明勋, 俎佳星, 周全, 陈宁, 刘瑶杰, 蓝健均, 蔡绍荣, 张戈. 藏中联网工程生态系统服务功能重要性评价 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(2): 593-603.
[11]	刘华妍, 肖文发, 李奇, 田宇, 张倩如, 朱建华. 北京市生态系统服务时空变化与权衡分析 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(1): 209-219.
[12]	殷楠, 王帅, 刘焱序. 生态系统服务价值评估：研究进展与展望 [J]. 生态学杂志, 2021, 40(1): 233-244.
[13]	魏伟, 周陶, 郭泽呈, 李振亚, 张学渊. 基于遥感指数的干旱内陆河流域土地生态敏感性时空演变特征——以石羊河流域武威市为例 [J]. 生态学杂志, 2020, 39(9): 3068-3079.
[14]	康萨如拉, 牛建明, 张庆, 韩国栋, 宝海风. 羊草草原退化演替中的状态转变和可持续性 [J]. 生态学杂志, 2020, 39(9): 3147-3154.
[15]	张舒昱, 李兆富, 徐锋, 潘剑君, 姜小三, 张文敏. 基于多时相无人机遥感影像优化河口湿地景观分类 [J]. 生态学杂志, 2020, 39(9): 3174-3184.