土壤微生物RAPD分析体系的优化研究

生态学杂志 ›› 2005, Vol. ›› Issue (8): 921-924.

土壤微生物RAPD分析体系的优化研究

焦晓丹¹, 吴凤芝¹, 高海军²

1. 东北农业大学园艺系, 哈尔滨, 150030;
2. 建三江大兴农场, 建三江, 156303

收稿日期:2005-01-12 修回日期:2005-01-24 出版日期:2005-08-10
通讯作者: 吴凤芝
基金资助:
国家自然科学基金(30230250);黑龙江省自然科学基金资助项目(C0215).

Optimization of RAPD conditions for soil microbes

JIAO Xiaodan¹, WU Fengzhi¹, GAO Haijun²

College of Horticulture, Northeast Agricultural University, Haerbin 150030, China

Received:2005-01-12 Revised:2005-01-24 Online:2005-08-10

摘要/Abstract

摘要： 采用正交实验设计,对影响土壤微生物RAPD扩增体系的Mg²⁺、dNTP浓度及引物浓度进行了研究,同时对退火温度、延伸时间及循环次数进行摸索。结果表明,适宜土壤微生物PCR扩增反应在25μl体积中进行,包括7ng土壤微生物DNA样品、20pm随机引物、1.5uTaq酶、3.0mmol.L^-1Mg-CL2和0.2mmol·L^-1dNTP。PCR扩增反应进程如下:94℃3min,使土壤DNA变性;然后再进行39个循环,每个循环包括94℃1min,37℃40s,72℃90s,结束后72℃延伸7min。

关键词: 流域, 生态系统, 森林, 水量平衡

Abstract: With orthogonal experiment,this paper studied the effects of the concentrations of Mg²⁺,dNTP and primer,the anneal temperature,and the extending time and cycling times on RAPD of soil microbes.The results showed that the feasible PCR reaction system for soil microbes should be carried in 25 μl volume,which was composed of 7 ng soil microbial DNA template,20 pm random primer,l.5 uTaq enzyme,3.0 mmol·L^-1 Mg-CL₂,and 0.2 mmol·L^-1dNTP.The PCR reaction procedure was firstly,keeping 94 for 3 min to make soil microbial DNA denatualize followed by 39 cycles,each including 94 for 1 min,37 for 40 s,and 72 for 1.5 min,and finally,keeping 72 for 7 min for extending.

Key words: Watershed, Ecosystem, Forest, Water balance

中图分类号:

S512

焦晓丹, 吴凤芝, 高海军. 土壤微生物RAPD分析体系的优化研究[J]. 生态学杂志, 2005, (8): 921-924.

JIAO Xiaodan, WU Fengzhi, GAO Haijun. Optimization of RAPD conditions for soil microbes[J]. cje, 2005, (8): 921-924.

[1]	陈本学, 李雁冰, 张慧斌, 王娅婷, 李文博. 切根贴膜对豫东平原农田防护林白花泡桐光合能力的影响 [J]. 生态学杂志, 2024, 43(4): 1008-1016.
[2]	宋伟, 王运涛, 王立波, 吴倩, 彭岩波. 基于多源遥感影像的作物信息提取与需水量时空分析#br# [J]. 生态学杂志, 2024, 43(4): 1113-1121.
[3]	杨元征, 蒙洲菊, 苏宏新, 王嘉丽, 蔡文华, 杨健, 俎佳星. 金钟山亚热带森林林窗特征与木本植物多样性的关系 [J]. 生态学杂志, 2024, 43(3): 675-681.
[4]	高小梅, 李燕丽, 熊勤学, 徐乐, 李继福, 李新竹, 王晓军. 受渍冬小麦不同叶位叶片的SPAD高光谱估算 [J]. 生态学杂志, 2024, 43(3): 733-740.
[5]	郭安琪, 刘昱坤, 于新文, 张旭, 陈艳, 罗丽, 高家军, 杨蔡芸. 海南长臂猿生境的声景观与声学活动评估 [J]. 生态学杂志, 2024, 43(3): 804-814.
[6]	杨菡, 李晓娜, 邓忠坚, 张卓亚, 潘慧萍. 基于土地利用/覆被的滇池流域生境质量时空演变 [J]. 生态学杂志, 2024, 43(3): 842-850.
[7]	张婷, 刘士余, 盛菲, 李俊, 余敏琪. 赣江上游章水流域水沙变化及其归因分析 [J]. 生态学杂志, 2024, 43(3): 861-868.
[8]	巫清芸, 吴志伟, 林世滔, 李顺, 谢谷艾. 赣南地区森林可燃物分类及其火行为预测 [J]. 生态学杂志, 2024, 43(2): 314-324.
[9]	郑陈悦, 林海川, 詹笑宇, 黄紫颜, 马远帆, 郑文霞, 朱忠盼, 郭福涛. 福建省主要乔木树种森林可燃物元素含量与燃烧释放PM_2.5中元素含量相关性分析 [J]. 生态学杂志, 2024, 43(2): 333-341.
[10]	胡同欣, 丁海磊, 孙龙. 火干扰对森林土壤氮素循环与转化的影响研究进展 [J]. 生态学杂志, 2024, 43(2): 372-382.
[11]	闫明, 刘晓宇, 刘志萍, 刘青青, 奚为民. 特大干旱后美国德克萨斯州东部国家森林碳动态及其驱动因素 [J]. 生态学杂志, 2024, 43(2): 395-406.
[12]	何洋, 赵喜萍. 基于标准化遥感生态指数的汾河流域生态评价与时序分析 [J]. 生态学杂志, 2024, 43(2): 564-575.
[13]	潘英, 王子进, 杨静怡. 贵阳城市化和边缘效应对城市残存森林木本植物系统发育特征的复合影响 [J]. 生态学杂志, 2024, 43(1): 106-114.
[14]	杨海江, 勾晓华, 唐呈瑞, 薛冰. 2010—2021年中国森林生态系统服务功能价值评估研究进展 [J]. 生态学杂志, 2024, 43(1): 244-253.
[15]	张志斌, 于晓曼, 刘鸣达, 李金妮. 基于能值分析的重工业区域绿色生态一体化发展研究 [J]. 生态学杂志, 2023, 42(8): 1963-1972.